Imaris软件做为一个多维图像处理软件，可对Olympus、Nikon、Zeiss、Leica等多种显微镜厂商的成像数据进行多维展示与定量分析。它主要包含surface、spots、cell、Filaments板块，还有一些小工具（Vantage、Coloc、Annotate、Snapshot、Animation、Batch）。它具备展示、分析、测量和演绎等所有3D/4D显微图像所必须的功能，例如：多维图像渲染、多维空间测量、运动轨迹追踪、图像共定位分析、神经元（丝状细胞）分析、细胞分析、序列图片自动偏移校正（Auto Aligner、voloom 软件）和动画制作，以及数据批量处理功能。结果可以导出到通用的Excel表格中，也可以直接标注在图像上，或者直接录制为直观的视频电影。

应用举例

1、图像展示和重构功能

Imaris具备Slice,Section,Gallery,3D volume等观察模式；亦可进行重构，进而看清不同结构之间的位置关系，此外还可以通过重构surface结构获得特定参数的精确定量结果。

2、神经分析

针对神经进行树突和树突棘的专业分析，包括瘦长型、蘑菇型、短粗型及丝状伪足型树突棘类型的精确分类，以及对树突和树突棘的长度、直径等多种参数的准确测量。

3、细胞计数和轨迹追踪

根据对象运动特点，包括Brownian Motion，Autoregressive Motion，Autoregressive Motion Expert，Connected Components和Lineage，针对信号体积、表面积、强度、形状改变和轨迹运动等参数生成统计信息。

4、共定位分析

Imaris软件有专业的共定位分析板块，可以采用手动设定阈值或者Costes自动计算阈值的方法进行共定位分析，并结合ROI的选取，可得到整张图像或选定区域的共定位系数。

5、细胞分析

专门的细胞分析板块可以计算得到大量数据，例如细胞内囊泡的数目，细胞内囊泡到细胞核和细胞膜的距离、细胞和细胞核的圆度等等。

1、荧光图像、DIC图像、电镜图像等。

2、XY、XYZ、XYZT、XYZTC等 2D-6D图像。