服务项目

DIA/SWATH蛋白质组非标记定量

发布时间: 2023-03-01 12:58:13

非数据依赖采集蛋白质组分析 DIA(data independent acquisition)/SWATH(sequential window acquisition of all theoretical fragment ions)蛋白质组分析技术, 是将整个质谱扫描质量范围分为若干个质量窗口,再依次对每个质量窗口的所有离子进行碎裂并采集全部子离子的质谱信息。该技术无需指定目标肽段,扫描点数均匀,利用谱图库即可实现定性分析和定量离子筛选,同时可实现数据回溯。

 

应用领域

适用于多生物样本中的蛋白质组非标定量比较,发现差异蛋白质。

 

技术优点

1、相比DDA技术的非标定量结果,定量重现性和准确度更高。

2、定量蛋白质通量高,能同时实现8000种以上蛋白质的定量分析。

 

可选仪器

Ekspertnano LC425-Triple TOF 6600

Q Exactive HF

Q Exactive HF-X

Orbitrap Fusion™ Tribrid™

EOrbitrap Fusion™ Lumos™ Tribrid™

FAIMS Orbitrap Exploris 480等

 

分析流程

 

 

1、蛋白质提取、样品经胰酶酶切和脱盐。
2、采用常规DDA质谱检测技术分析建立图谱库。
3、采用DIA/SWATH方法进行质谱数据采集。
4、采用Skyline、Spectronaut等软件进行质谱数据处理。

 

可选数据分析

1、数据产出统计蛋白质/肽段鉴定及定量结果。

2、差异蛋白质统计分析。

3、蛋白质GO分析及差异蛋白GO富集分析。

4、蛋白质Pathway通路分析及差异蛋白的Pathway通路分析。

5、多样品间表达模式聚类分析(适用于样本数≥3的项目)。

 

样品要求
蛋白提取物:≥50μg
细胞:≥106
组织:动物组织≥10mg,植物组织:≥100mg
体液:血清≥5μL,脑脊液:≥10μL
★ 注:具体样品需要量根据实验方案有所不同。

 

联系我们

王老师:13718492515
张老师:13683167093

 

 

 

非数据依赖采集蛋白质组分析 DIA(data independent acquisition)/SWATH(sequential window acquisition of all theoretical fragment ions)蛋白质组分析技术, 是将整个质谱扫描质量范围分为若干个质量窗口,再依次对每个质量窗口的所有离子进行碎裂并采集全部子离子的质谱信息。该技术无需指定目标肽段,扫描点数均匀,利用谱图库即可实现定性分析和定量离子筛选,同时可实现数据回溯。

 

应用领域

适用于多生物样本中的蛋白质组非标定量比较,发现差异蛋白质。

 

技术优点

1、相比DDA技术的非标定量结果,定量重现性和准确度更高。

2、定量蛋白质通量高,能同时实现8000种以上蛋白质的定量分析。

 

可选仪器

Ekspertnano LC425-Triple TOF 6600

Q Exactive HF

Q Exactive HF-X

Orbitrap Fusion™ Tribrid™

EOrbitrap Fusion™ Lumos™ Tribrid™

FAIMS Orbitrap Exploris 480等

 

分析流程

 

 

1、蛋白质提取、样品经胰酶酶切和脱盐。
2、采用常规DDA质谱检测技术分析建立图谱库。
3、采用DIA/SWATH方法进行质谱数据采集。
4、采用Skyline、Spectronaut等软件进行质谱数据处理。

 

可选数据分析

1、数据产出统计蛋白质/肽段鉴定及定量结果。

2、差异蛋白质统计分析。

3、蛋白质GO分析及差异蛋白GO富集分析。

4、蛋白质Pathway通路分析及差异蛋白的Pathway通路分析。

5、多样品间表达模式聚类分析(适用于样本数≥3的项目)。

 

样品要求
蛋白提取物:≥50μg
细胞:≥106
组织:动物组织≥10mg,植物组织:≥100mg
体液:血清≥5μL,脑脊液:≥10μL
★ 注:具体样品需要量根据实验方案有所不同。

 

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