姓       名：

陈涛

职称及职务：

副研究员，硕导

招生专业：

生物信息学

研 究 方 向：

蛋白质组信息学

大数据平台研发及应用

联系方式：

邮  箱：taochen1019@163.com

电  话：010-61777053

主要科研领域与方向：

曾在加拿大滑铁卢大学计算机系访问学习18个月。主要从事蛋白质组信息学、大数据平台及应用研究。以第一/共同第一作者，通讯/共同通讯作者在 Nucleic Acids Research、IEEE Transactions on Knowledge and Data Engineering、Bioinformatics、Proteomics 等学术期刊发表论文20余篇，其中SCI影响因子10分以上的有2篇，CCF A类期刊1篇，单篇最高他引次数1000余次，获评“2019年中国百篇最具影响国际学术论文”。研发了国际公认的蛋白质组数据共享和分析平台iProX，是国际蛋白质组数据联盟ProteomeXchange（PX）中国唯一一位正式成员，汇聚数据337TB，保护了国家的遗传数据资源，维护了国家的生物数字主权。获2020年中国发明协会发明创新奖一等奖。作为课题负责人和骨干成员先后主持和参与了包括国家自然科学青年基金、国家重点研发计划、国家高技术研究发展计划、国际科技合作专项、战略性科技创新合作等在内的科研项目10余项。

代表性论文（*共同通讯作者，#共同第一作者）：

1. Chen T^#, Ma J^#, Liu Y, Chen Z, Xiao N, Lu Y, Fu Y, Yang C, Li M, Wu S, Wang X, Li D, He F*, Hermjakob H*, Zhu Y*. iProX in 2021: connecting proteomics data sharing with big data. Nucleic Acids Res. 2022 Jan 7;50(D1):D1522-D1527. (IF-14.9)

2. Ma J^#, Chen T^#, Wu S, Yang C, Bai M, Shu K, Li K, Zhang G, Jin Z, He F*, Hermjakob H*, Zhu Y*. iProX: an integrated proteome resource. Nucleic Acids Res. 2019 Jan 8;47(D1):D1211-D1217. (IF-11.501)

3. Xu X#, Li C#, Yuan X#, Zhang Q, Liu Y, Zhu Y* and Chen T*. ACP-DRL: an anticancer peptides recognition method based on deep representation learning. Frontiers in Genetics. 2024, 15:1376486. (IF-3.7)

4. Li M, He Q, Ma J, He F, Zhu Y, Chang C, Chen T*. PPICurator: A Tool for Extracting Comprehensive Protein-Protein Interaction Information. Proteomics. 2019 Feb;19(4):e1800291. (IF-3.254) 

5. Li C, Chen T^#, He Q, Zhu Y, Li K*. MRUniNovo: an efficient tool for de novo peptide sequencing utilizing the hadoop distributed computing framework. Bioinformatics. 2017 Mar 15;33(6):944-946. (IF-5.481)