研究团队成员列表

李乐园

发布时间: 2024-07-30 16:25:51

姓       名:

李乐园

职称及职务:

研究员,硕导

招生专业:

 

微生物学

 

研 究 方 向:

宏蛋白质组与微生物生态

联系方式:

邮  箱:lileyuan2022@163.com

电  话:13552558067

主要科研领域与方向:

特聘研究员,北京市高端领军人才自然科学研究系列研究员,“北京项目”获得者。2022年8月加入研究所,研究方向为宏蛋白质组与微生物生态研究。作为项目(课题)负责人主持国家自然科学基金面上项目等课题三项。课题组建立了完整的宏蛋白质组学分析及微生物体外生态学研究技术体系,并创新性地开发一系列基于宏蛋白质组学的微生物生态学实验和计算方法,包括蛋白质组水平功能冗余度计算,基于配对宏蛋白质组-宏基因组的蛋白质生态学功能推断,基于宏蛋白质组和系统发生树的β多样性计算方法等等系列新方法,结合系列实验技术评价和调控微生物生态系统稳态。目前在 Nature Communications、Microbiome, Gut Microbes, iMeta 等杂志发表SCI论文40余篇,含封面文章4篇。兼任国际宏蛋白质组学组织(Metaproteomic Initiative)首届和第二届执行委员会成员。

代表性论文(*共同通讯作者,#共同第一作者)

1. Leyuan Li#, Tong Wang#, Zhibin Ning, et al.  Revealing proteome-level functional redundancy in the human gut microbiome using ultra-deep metaproteomics . Nat Commun, 2023, 14:3428.

2. Leyuan Li#, Zhibin Ning#, Kai Cheng, et al.  iMetaLab Suite: a one-stop toolset for metaproteomics. iMeta, 2022, 2:e25.

3. Leyuan Li, Zhibin Ning, Xu Zhang, et al.  RapidAIM: a culture-and metaproteomics- based rapid assay of individual microbiome responses to drugs. Microbiome, 2020, 8: 1-16.

4. Leyuan Li, Lu Chang, Xu Zhang, et al.  Berberine and its structural analogs have differing effects on functional profiles of indivudal gut microbiomes. Gut Microbes, 2020, 11(5): 1348-1361.

5. Leyuan Li#, Elias Abou-Samra#, Zhibin Ning, et al. An in vitro model maintaining taxon-specific functional activities of the gut microbiome. Nat Commun, 2019, 10(1): 4146.

姓       名:

李乐园

职称及职务:

研究员,硕导

招生专业:

 

微生物学

 

研 究 方 向:

宏蛋白质组与微生物生态

联系方式:

邮  箱:lileyuan2022@163.com

电  话:13552558067

主要科研领域与方向:

特聘研究员,北京市高端领军人才自然科学研究系列研究员,“北京项目”获得者。2022年8月加入研究所,研究方向为宏蛋白质组与微生物生态研究。作为项目(课题)负责人主持国家自然科学基金面上项目等课题三项。课题组建立了完整的宏蛋白质组学分析及微生物体外生态学研究技术体系,并创新性地开发一系列基于宏蛋白质组学的微生物生态学实验和计算方法,包括蛋白质组水平功能冗余度计算,基于配对宏蛋白质组-宏基因组的蛋白质生态学功能推断,基于宏蛋白质组和系统发生树的β多样性计算方法等等系列新方法,结合系列实验技术评价和调控微生物生态系统稳态。目前在 Nature Communications、Microbiome, Gut Microbes, iMeta 等杂志发表SCI论文40余篇,含封面文章4篇。兼任国际宏蛋白质组学组织(Metaproteomic Initiative)首届和第二届执行委员会成员。

代表性论文(*共同通讯作者,#共同第一作者)

1. Leyuan Li#, Tong Wang#, Zhibin Ning, et al.  Revealing proteome-level functional redundancy in the human gut microbiome using ultra-deep metaproteomics . Nat Commun, 2023, 14:3428.

2. Leyuan Li#, Zhibin Ning#, Kai Cheng, et al.  iMetaLab Suite: a one-stop toolset for metaproteomics. iMeta, 2022, 2:e25.

3. Leyuan Li, Zhibin Ning, Xu Zhang, et al.  RapidAIM: a culture-and metaproteomics- based rapid assay of individual microbiome responses to drugs. Microbiome, 2020, 8: 1-16.

4. Leyuan Li, Lu Chang, Xu Zhang, et al.  Berberine and its structural analogs have differing effects on functional profiles of indivudal gut microbiomes. Gut Microbes, 2020, 11(5): 1348-1361.

5. Leyuan Li#, Elias Abou-Samra#, Zhibin Ning, et al. An in vitro model maintaining taxon-specific functional activities of the gut microbiome. Nat Commun, 2019, 10(1): 4146.