研究团队成员列表

朱云平

发布时间: 2024-07-30 16:25:45

姓       名:

朱云平

职称及职务:

研究员,博导

招生专业:

 

生物信息学

医学蛋白质组学

 

研 究 方 向:

多组学大数据分析

联系方式:

邮  箱:zhuyunping@gmail.com

电  话:010-61777058, 13331123032

主要科研领域与方向:

国家蛋白质科学中心生物信息学实验室PI,863重大项目首席专家,中国医药生物技术协会生物医学信息技术分会副主任委员,国家科技部BT与IT融合领域专家。

研究方向为生物医学大数据挖掘。建立了国内最早的蛋白质组信息学研究团队,研发了蛋白质组信息学系列算法并应用于多个大型研究项目,设计和建立了国家蛋白质科学中心(北京)生物信息学平台。建立的iProX是国际学术界公认的蛋白质组数据共享发布平台。在 Nucleic Acids Res、Nat. Commun、Mol Cell Proteomics、Bioinformatics等期刊发表SCI论文两百余篇,其中iProX研发论文被评为2019年中国百篇最具影响国际学术论文。主持的“蛋白质组信息学方法的研究及其支撑平台的构建和应用”获中国电子信息科学技术奖一等奖。此外获国家科技进步创新团队奖、北京市科学技术奖一等奖、中华预防医学科技奖一等奖、教学成果一等奖等。

代表性论文(*共同通讯作者,#共同第一作者)

1. Chen T*, Ma J*, Liu Y, Chen Z, Xiao N, Lu Y, Fu Y, Yang C, Li M, Wu S, Wang X, Li D, He F#, Hermjakob H#, Zhu Y#. iProX in 2021: connecting proteomics data sharing with big data. Nucleic Acids Res. 2022 Jan 7;50(D1):D1522-D1527. (IF 19.160)

2. Han M*, Liu X*, Zhang W*, Wang M, Bu W, Chang C, Yu M, Li Y, Tian C, Yang X#, Zhu Y#, He F#. TSMiner: a novel framework for generating time-specific gene regulatory networks from time-series expression profiles. Nucleic Acids Res. 2021 Oct 11;49(18):e108. (IF 19.160)

3. Li J*#, Ma J*, Zhang Q*, Gong H, Gao D, Wang Y, Li B, Li X, Zheng H, Wu Z, Zhu Y#, Leng L#. Spatially resolved proteomic map shows that extracellular matrix regulates epidermal growth. Nat Commun. 2022 Jul 11;13(1):4012. (IF 17.694)

4. Ma J*, Chen T*, Wu S, Yang C, Bai M, Shu K, Li K, Zhang G, Jin Z, He F#, Hermjakob H#, Zhu Y#. iProX: an integrated proteome resource. Nucleic Acids Res. 2019 Jan 8;47(D1):D1211-D1217.  (IF 11.147)

5. Li X, Ma J, Leng L, Han M, Li M, He F#, Zhu Y#. MoGCN: A Multi-Omics Integration Method Based on Graph Convolutional Network for Cancer Subtype Analysis. Front Genet. 2022 Feb 2;13:806842. (IF 4.772)

姓       名:

朱云平

职称及职务:

研究员,博导

招生专业:

 

生物信息学

医学蛋白质组学

 

研 究 方 向:

多组学大数据分析

联系方式:

邮  箱:zhuyunping@gmail.com

电  话:010-61777058, 13331123032

主要科研领域与方向:

国家蛋白质科学中心生物信息学实验室PI,863重大项目首席专家,中国医药生物技术协会生物医学信息技术分会副主任委员,国家科技部BT与IT融合领域专家。

研究方向为生物医学大数据挖掘。建立了国内最早的蛋白质组信息学研究团队,研发了蛋白质组信息学系列算法并应用于多个大型研究项目,设计和建立了国家蛋白质科学中心(北京)生物信息学平台。建立的iProX是国际学术界公认的蛋白质组数据共享发布平台。在 Nucleic Acids Res、Nat. Commun、Mol Cell Proteomics、Bioinformatics等期刊发表SCI论文两百余篇,其中iProX研发论文被评为2019年中国百篇最具影响国际学术论文。主持的“蛋白质组信息学方法的研究及其支撑平台的构建和应用”获中国电子信息科学技术奖一等奖。此外获国家科技进步创新团队奖、北京市科学技术奖一等奖、中华预防医学科技奖一等奖、教学成果一等奖等。

代表性论文(*共同通讯作者,#共同第一作者)

1. Chen T*, Ma J*, Liu Y, Chen Z, Xiao N, Lu Y, Fu Y, Yang C, Li M, Wu S, Wang X, Li D, He F#, Hermjakob H#, Zhu Y#. iProX in 2021: connecting proteomics data sharing with big data. Nucleic Acids Res. 2022 Jan 7;50(D1):D1522-D1527. (IF 19.160)

2. Han M*, Liu X*, Zhang W*, Wang M, Bu W, Chang C, Yu M, Li Y, Tian C, Yang X#, Zhu Y#, He F#. TSMiner: a novel framework for generating time-specific gene regulatory networks from time-series expression profiles. Nucleic Acids Res. 2021 Oct 11;49(18):e108. (IF 19.160)

3. Li J*#, Ma J*, Zhang Q*, Gong H, Gao D, Wang Y, Li B, Li X, Zheng H, Wu Z, Zhu Y#, Leng L#. Spatially resolved proteomic map shows that extracellular matrix regulates epidermal growth. Nat Commun. 2022 Jul 11;13(1):4012. (IF 17.694)

4. Ma J*, Chen T*, Wu S, Yang C, Bai M, Shu K, Li K, Zhang G, Jin Z, He F#, Hermjakob H#, Zhu Y#. iProX: an integrated proteome resource. Nucleic Acids Res. 2019 Jan 8;47(D1):D1211-D1217.  (IF 11.147)

5. Li X, Ma J, Leng L, Han M, Li M, He F#, Zhu Y#. MoGCN: A Multi-Omics Integration Method Based on Graph Convolutional Network for Cancer Subtype Analysis. Front Genet. 2022 Feb 2;13:806842. (IF 4.772)