研究团队成员列表

杨冬

发布时间: 2024-07-30 16:24:44

姓       名:

杨冬

职称及职务:

副研究员,硕导

招生专业:

 

生物化学与分子生物学

公共卫生硕士

 

研 究 方 向:

 

极端生命体或肿瘤组学大数据知识挖掘及应用

 

联系方式:

邮  箱:yangdongbprc@163.com

电  话:61777051,13581984573(微信)

主要科研领域与方向:

主要基于生命组学大数据开展进化发育系统生物学新理论新方法及其医学应用研究。承担国家科技部、国家自然科学基金委、北京市等各类课题10余项;以第一或责任作者累计发表论著30余篇(单篇最高影响因子为16.2);获软件著作权8项;获国际人类蛋白质组组织 2015年度优秀青年学者奖;作为参与人获中国电子学会电子信息科学技术进步一等奖1项;培养研究生累计20名;任科技部项目评审专家、多部杂志审稿专家;被评为北京市科技新星。

具体研究方向包括:

1) 生命组学大数据知识挖掘:生物系统分子构成、调控规律及生物学复杂性实现规律。

2) 特定过程/功能机制的组学研究:胚胎干细胞分化机制的进化、极端生命体(水熊虫、耐辐射奇球菌)特殊功能形成机制的组学研究。正在开展的特色研究内容之一:在国际上首次建立了河南高生熊虫规模化实验室培养体系,并进行了三代基因组测序,目前正基于多维组学研究其超强辐射耐受机制及胚胎发育机制。经过五年多的前期积累,正处于重要成果陆续产出阶段。

3) 进化发育系统生物学的医学应用:肿瘤进化组学及其应用。 

代表性论文(*共同通讯作者,#共同第一作者)

1. Weiren Liu, Huqiang Wang, Qianfu Zhao, Chenyang Tao, …, Zheng Tang*, Dong Yang*, Yinghong Shi*. Multiomics analysis reveals metabolic subtypes and identifies diacylglycerol kinase α (DGKA) as a potential therapeutic target for intrahepatic cholangiocarcinoma. Cancer Commun (Lond). 2024 Feb;44(2):226-250.

2. Liu S, Wang F, Chen H, Yang Z, Ning Y, Chang C, Yang D*. New Insights into Radio-Resistance Mechanism Revealed by (Phospho)Proteome Analysis of Deinococcus Radiodurans after Heavy Ion Irradiation. Int. J. Mol. Sci. 2023, 24, 14817.

3. Zheng K#, Hou Y#, Zhang Y#, Wang F*, Sun A*, Yang D*. Molecular features and predictive models identify the most lethal subtype and a therapeutic target for osteosarcoma. Frontiers in oncology. 2023.02. 13:1111570.

4. Wang H, Zhong H, Gao C, Zang J, Yang D*. The distinct properties of the consecutive disordered regions inside or outside protein domains and their functional significance. Int. J. Mol. Sci. 2021, 22, 10677.

5. Gao C#, Ma C#, Wang H, Zhong H, Zang J, Zhong R, He F*, Yang D#, *. Intrinsic disorder in protein domains contributes to both organism complexity and clade-specific functions. Scientific Reports. 2021. 11(1):2985.

姓       名:

杨冬

职称及职务:

副研究员,硕导

招生专业:

 

生物化学与分子生物学

公共卫生硕士

 

研 究 方 向:

 

极端生命体或肿瘤组学大数据知识挖掘及应用

 

联系方式:

邮  箱:yangdongbprc@163.com

电  话:61777051,13581984573(微信)

主要科研领域与方向:

主要基于生命组学大数据开展进化发育系统生物学新理论新方法及其医学应用研究。承担国家科技部、国家自然科学基金委、北京市等各类课题10余项;以第一或责任作者累计发表论著30余篇(单篇最高影响因子为16.2);获软件著作权8项;获国际人类蛋白质组组织 2015年度优秀青年学者奖;作为参与人获中国电子学会电子信息科学技术进步一等奖1项;培养研究生累计20名;任科技部项目评审专家、多部杂志审稿专家;被评为北京市科技新星。

具体研究方向包括:

1) 生命组学大数据知识挖掘:生物系统分子构成、调控规律及生物学复杂性实现规律。

2) 特定过程/功能机制的组学研究:胚胎干细胞分化机制的进化、极端生命体(水熊虫、耐辐射奇球菌)特殊功能形成机制的组学研究。正在开展的特色研究内容之一:在国际上首次建立了河南高生熊虫规模化实验室培养体系,并进行了三代基因组测序,目前正基于多维组学研究其超强辐射耐受机制及胚胎发育机制。经过五年多的前期积累,正处于重要成果陆续产出阶段。

3) 进化发育系统生物学的医学应用:肿瘤进化组学及其应用。 

代表性论文(*共同通讯作者,#共同第一作者)

1. Weiren Liu, Huqiang Wang, Qianfu Zhao, Chenyang Tao, …, Zheng Tang*, Dong Yang*, Yinghong Shi*. Multiomics analysis reveals metabolic subtypes and identifies diacylglycerol kinase α (DGKA) as a potential therapeutic target for intrahepatic cholangiocarcinoma. Cancer Commun (Lond). 2024 Feb;44(2):226-250.

2. Liu S, Wang F, Chen H, Yang Z, Ning Y, Chang C, Yang D*. New Insights into Radio-Resistance Mechanism Revealed by (Phospho)Proteome Analysis of Deinococcus Radiodurans after Heavy Ion Irradiation. Int. J. Mol. Sci. 2023, 24, 14817.

3. Zheng K#, Hou Y#, Zhang Y#, Wang F*, Sun A*, Yang D*. Molecular features and predictive models identify the most lethal subtype and a therapeutic target for osteosarcoma. Frontiers in oncology. 2023.02. 13:1111570.

4. Wang H, Zhong H, Gao C, Zang J, Yang D*. The distinct properties of the consecutive disordered regions inside or outside protein domains and their functional significance. Int. J. Mol. Sci. 2021, 22, 10677.

5. Gao C#, Ma C#, Wang H, Zhong H, Zang J, Zhong R, He F*, Yang D#, *. Intrinsic disorder in protein domains contributes to both organism complexity and clade-specific functions. Scientific Reports. 2021. 11(1):2985.