代谢组/脂质组数据分析
发布时间: 2023-03-13 15:20:03
代谢组/脂质组反映的是整个生命体最末端的活动,比如产生能量、物质等;代谢组的结果易于理解,容易与表型和功能结合,然而代谢分子具有很强的动态性和复杂性。其动态性和复杂性对代谢组学的数据分析提出了很高的要求。针对代谢组及脂质组数据,生信平台建立了数据预处理、多元统计分析及机器学习建模流程,对数据进行处理、挖掘及可视化。
技术优点
分析方法采用最新自研或主流算法(特别是数据归一化、批次效应校正及降维算法方面),所依据的特征注释信息均采用可信度高且及时更新的二级谱图库。
分析流程
可选择分析项目
1、差异分析。
2、降维、聚类分析。
3、代谢通路分析。
4、模型诊断模型构建。
5、代谢组与蛋白质组整合分析。
结果示例
数据要求
1、清晰的实验设计、技术流程及实验批次信息;
2、详细的样本信息
合作案例
Qian, Xu, et al. Integrated analysis of circulating and tissue proteomes reveal fibronectin 1 is a potential biomarker in papillary thyroid cancer. BMC Cancer (2023).
联系方式
李老师:15001129617
代谢组/脂质组反映的是整个生命体最末端的活动,比如产生能量、物质等;代谢组的结果易于理解,容易与表型和功能结合,然而代谢分子具有很强的动态性和复杂性。其动态性和复杂性对代谢组学的数据分析提出了很高的要求。针对代谢组及脂质组数据,生信平台建立了数据预处理、多元统计分析及机器学习建模流程,对数据进行处理、挖掘及可视化。
技术优点
分析方法采用最新自研或主流算法(特别是数据归一化、批次效应校正及降维算法方面),所依据的特征注释信息均采用可信度高且及时更新的二级谱图库。
分析流程
可选择分析项目
1、差异分析。
2、降维、聚类分析。
3、代谢通路分析。
4、模型诊断模型构建。
5、代谢组与蛋白质组整合分析。
结果示例
数据要求
1、清晰的实验设计、技术流程及实验批次信息;
2、详细的样本信息
合作案例
Qian, Xu, et al. Integrated analysis of circulating and tissue proteomes reveal fibronectin 1 is a potential biomarker in papillary thyroid cancer. BMC Cancer (2023).
联系方式
李老师:15001129617