蛋白质邻近标记技术
发布时间: 2023-03-02 09:01:05
蛋白质功能平台目前可采用BiolD和其改进后的TurbolD邻近标记技术配合质谱技术进行蛋白质相互作用组学的研究，这是一项目前广泛应用于研究蛋白质相互作用的技术，与传统AP-MS相比，具有操作简便、可重复性好、应用广泛等特点。
应用领域
1、常用于半内源细胞蛋白的相互作用检测，也可应用干细胞、模式生物目的蛋白的相互作用筛选与组学研究。
2、用于检测相互作用结合力差的相互作用、改进后的技术可提高对弱的、瞬时相互作用的检测。
技术优点
1、生物素标记，结合力强且稳定;后期可用严格的方法去除背景而不用担心破坏标记。
2、不需要维持原来的相互作用，操作难度显著降低、且结果重复性好。
3、配合质谱技术和生物信息学分析，可较为直观、全面地研究蛋白相互作用及组学。
4、常见细胞系均可应用，只需要转染或稳定表达带生物素连接酶的目的蛋白的DNA; 只需要添加生物素、对细胞生长没有明显影响。
可选方案
| 链霉亲和素富集、抗生物素抗体富集;生物素化蛋白富集、生物素化肽段富集 |
| LC-MS/MS多设备可选∶ Q Exactive、Q Exactive plus、Q Exactive HF、Q Exactive HF-X等。 |
分析流程
1、融合表达载体构建。
2、细胞转染及表达检测。
3、邻近标记实验与标记蛋白/肽段富集。
4、质谱检测和生物信息学数据分析。
可选数据分析
1、样品相关性分析（重复性分析） 。
2、结果可信度打分。
3、聚类分析、差异蛋白分析及GO分析。
4、蛋白质Pathway通路分析及差异蛋白的Pathway通路分析。
样本要求
1、目标蛋白的DNA序列。
2、目标细胞系及转染方法或稳定表达目标融合蛋白的细胞株。
联系我们
金老师：13466517742
蛋白质功能平台目前可采用BiolD和其改进后的TurbolD邻近标记技术配合质谱技术进行蛋白质相互作用组学的研究，这是一项目前广泛应用于研究蛋白质相互作用的技术，与传统AP-MS相比，具有操作简便、可重复性好、应用广泛等特点。
应用领域
1、常用于半内源细胞蛋白的相互作用检测，也可应用干细胞、模式生物目的蛋白的相互作用筛选与组学研究。
2、用于检测相互作用结合力差的相互作用、改进后的技术可提高对弱的、瞬时相互作用的检测。
技术优点
1、生物素标记，结合力强且稳定;后期可用严格的方法去除背景而不用担心破坏标记。
2、不需要维持原来的相互作用，操作难度显著降低、且结果重复性好。
3、配合质谱技术和生物信息学分析，可较为直观、全面地研究蛋白相互作用及组学。
4、常见细胞系均可应用，只需要转染或稳定表达带生物素连接酶的目的蛋白的DNA; 只需要添加生物素、对细胞生长没有明显影响。
可选方案
| 链霉亲和素富集、抗生物素抗体富集;生物素化蛋白富集、生物素化肽段富集 |
| LC-MS/MS多设备可选∶ Q Exactive、Q Exactive plus、Q Exactive HF、Q Exactive HF-X等。 |
分析流程
1、融合表达载体构建。
2、细胞转染及表达检测。
3、邻近标记实验与标记蛋白/肽段富集。
4、质谱检测和生物信息学数据分析。
可选数据分析
1、样品相关性分析（重复性分析） 。
2、结果可信度打分。
3、聚类分析、差异蛋白分析及GO分析。
4、蛋白质Pathway通路分析及差异蛋白的Pathway通路分析。
样本要求
1、目标蛋白的DNA序列。
2、目标细胞系及转染方法或稳定表达目标融合蛋白的细胞株。
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